您身边的生物信息分析师!

    南京迪康金诺生物技术有限公司

    案列中心
    网站首页 > 客户案例

    我公司客户在Plos One上发表文章

    热烈祝贺我公司客户南京农业大学动物科技学院刘文斌课题组利用我们公司的RNA-seq服务,在Plos One上发表题为“The Effect of Exposure to a High-Fat Diet on MicroRNA Expression in the Liver of Blunt Snout Bream (Megalobrama amblycephala)”文章。

     

    研究摘要:在现代集约化养殖模式下,团头鲂(团头鲂)很容易受到脂肪肝的困扰。本研究的目的是探讨该物种在饮食诱导的脂肪肝发生过程中RNAmiRNA潜在作用。miRNA一种短的非编码RNA能够在转录后水平调节基因表达,参与多种生物过程,其中就包括脂质代谢。通过对喂食正常脂肪和高脂肪的团头鲂肝脏microRNA进行表达谱测序及生物信息学分析,鉴别出202miRNA分子193已知和9个未知),其中12miRNA正常脂肪和高脂肪的饮食组之间具有差异表达。RT-qPCR分别验证了在高脂肪组中表达上调的miR-30cmiR-30e-3P以及表达下调的miR-145miR-15a-5P随后我们通过生物信息学手段对这些差异表达的miRNA进了靶标基因预测GO注释和KEGG分析我们推测有6个与脂质代谢相关的靶基因(胎球蛋白-BCyp7a1基因,NADH脱氢酶(泛醌)1的β亚复合亚基23- 含氧酸CoA转移1b中,硬脂酰辅酶A去饱和酶,和脂肪酸合成酶)可能在饮食诱导的团头鲂脂肪肝发展过程中具有重要作用。我们的结果为进一步研究团头鲂脂质代谢过程中miRNA介导的调控网络奠定了基础。

    文章链接: http://www.plosone.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pone.0096132


    Powered by MetInfo 6.1.0 ©2008-2018 www.metinfo.cn