10x Genomics 单细胞转录组测序


    10x Genomics 单细胞转录组测序


       产品介绍  


        产品优势


        应用领域

        样本要求



       生信分析


         案例分享    


      利用单细胞转录组学和深层组织蛋白质组学成功绘制老化肺图谱

            衰老导致了肺功能下降,增加了慢性肺病的易感性,这已经成为全球第三大死亡原因。本研究利用单细胞测序研究年轻小鼠和老年小鼠的肺部细胞差异,以揭示肺部老年化的机制,从小鼠肺部的不同细胞类型,肺衰老过程中细胞变化和基因变化以及相关功能等方面切入探索。研究发现衰老导致了转录噪音的增加,表观调控异常以及细胞衰老的特征,同时,还发现型肺泡壁细胞和脂成纤维细胞中型胆固醇生物合成有所增加,且气道上皮细胞的相对比例发生了改变。蛋白质组学分析显示老年小鼠细胞外基质重构,包括IV 型胶原和XVI 型胶原增加,Fraser 综合征复杂蛋白和XIV 型胶原减少。本研究利用老化蛋白组与单细胞转录组的整合分析预测了调控蛋白的细胞来源,并创建了一个无偏倚的老化肺参考图谱。




      图1 研究技术路线图





      图2  小鼠肺部细胞亚群鉴定结果




      图3  衰老导致了大多数细胞的转录噪音增加



      图4  2 型肺泡细胞和脂成纤维细胞的型胆固醇生物合成的增加