真核转录组测序


    真核转录组测序


       产品介绍  
        产品优势


        应用领域





        样本要求


       生信分析

      定制化信息分析
      可结合客户的需求,协商确定定制化信息分析内容。


         案例分享   

      RNA测序确定了香烟烟雾暴露与人类气道上皮细胞复制性衰老之间的共同通路


      衰老受遗传和环境因素的影响,吸烟与衰老细胞的积累密切相关。在这项研究中,作者想要确定吸烟情况下潜在的有益于细胞生存的基因,从而可能有助于对细胞衰老发展的探索。该研究从5 个健康人中获取了原发性人支气管上皮细胞进行培养,然后使用(或不使用)1.5% 香烟烟雾提取物(CSE)处理24 小时,或者传代至复制衰老阶段,利用RNA-seq 对CSE 和non-CSE 处理的暴露细胞进行转录组测序,同时,对复制衰老阶段的细胞也进行转录组测序。研究发现1534 个基因在衰老过程中受到不同程度的调控,599 个基因在CSE 暴露后受到不同程度的调控,其中,243 个基因在两种条件下都发生了改变,表现为强富集,在两种条件下的通路和过表达基因集属于调节活性氧,蛋白酶体降解和NF-κB 信号的细胞过程。研究结果为了解细胞老化和暴露于香烟烟雾中的基因表达反应提供了深入的见解,并确定了被香烟烟雾改变的潜在分子通路,这些通路也可能促进气道上皮细胞衰老。

      图1 在pHBECs 中复制性衰老或CSE 暴露后表达变化的鉴定




      2 复制性衰老和CSE 诱导的基因表达变化之间存在明显的重叠



      3CSE和衰老反应基因共有的Pathway 富集结果