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    生活方式如何影响甲基化?

    2016-04-28 09:38:04 南京迪康金诺生物技术有限公司 阅读

    法国和加拿大的研究人员近日分析了中部非洲人群的血液甲基化模式,揭示了因环境和生活方式改变而引起的表观遗传变化。这项成果于11月30日发表在《NatureCommunications》上。

    研究人员以中部非洲热带雨林地区的数百名个体对研究对象,对他们的血液样本进行了表观基因组的芯片分析。这些个体要么是狩猎者,要么是农耕者,其中一部分是最近从田园生活转去森林生活。

    文章的通讯作者,巴斯德研究所的人类进化遗传学研究人员Lluis Quintana-Murci及其同事写道:“我们发现,群体当前的栖息地和历史的生活方式对甲基化组有着同样重要的影响,但影响的生物学功能却大不同。与栖息地相关的甲基化变化主要关系到免疫和细胞功能,而与生活方式相关的变化影响发育过程。”

    在这项研究中,他们利用Illumina的450K芯片来分析血液样本的全基因组SNP和甲基化模式。这些样本来自267名加蓬和喀麦隆个体,其中一组是112名来自热带雨林的狩猎者,另一组是94名传统的农耕者,还有61名来自农村,现在生活在森林里,以狩猎为生。

    研究人员利用类似的方法分析了另外近百个样本的DNA甲基化模式。这些样本来自乌干达地区的47名狩猎者和48名农耕者。在质量控制步骤之后,研究人员从其中352名个体中获得了超过36万个位点的DNA甲基化数据。

    总的来说,最明显的DNA甲基化差异出现在狩猎者和农耕者之间,而与他们目前的区域或生活方式无关。例如,研究人员在比较加蓬和喀麦隆的两组样本时,发现25,800多个区域出现甲基化差异。同样,对于乌干达的样本,19,401个区域因历史生活方式而出现甲基化差异。

    研究人员发现,对于那些栖息地改变的群体,他们的部分基因组往往发生甲基化变化,包括那些参与免疫、病原体反应和细胞功能的基因。然而,与历史生活方式相关的差异通常出现在那些与发育和生长相关的基因。

        “总之,这些研究结果表明,积极选择针对了DNA序列变异,它们直接或间接地影响了DNA甲基化的变化,”作者指出。“这些信号似乎在农业群体中更加明显,无论是东部还是西部,表明这些群体似乎存在更多的本土适应。”

    来源:生物通

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