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      实验设计-咨询服务专业系统的实验设计是科学研究取得重大成果的重要步骤。成功的实验方案能够最大程度的降低实验成本,提高实验效率,最大化实验成果。我们的顾问团队会根据多年的研究经验免费为您的科研任务提供详细的实验设计方案,包括分子生物学实验和生物信息学分析流程的设计。生物信息学分析1. 高通量DNA测序数据的生物信息学分析1)不同平台DNA测序数据的处理,包括 Sanger,&nb

      1. 详细信息

      实验设计-咨询服务

      专业系统的实验设计是科学研究取得重大成果的重要步骤。成功的实验方案能够最大程度的降低实验成本,提高实验效率,最大化实验成果。我们的顾问团队会根据多年的研究经验免费为您的科研任务提供详细的实验设计方案,包括分子生物学实验和生物信息学分析流程的设计。

      生物信息学分析

      1. 高通量DNA测序数据的生物信息学分析

      1)不同平台DNA测序数据的处理,包括 Sanger, Roche454, IlluminaHiSeq/Miseq, IlluminaSolexa,ABISOLiD/Ion Torrent测序数据以及多平台混合测序数据;

      2)可分析的测序数据包括:

      • Small RNA测序数据

      • RNA表达谱测序数据

      • 转录组测序数据

      • LncRNA测序数据

      • CircRNA测序数据

      • 基因组重测序数据

      • 全基因组甲基化测序数据

      • ChIP-seq数据

      • 基因组从头测序数据

      • 16s rRNA测序

      具体生物信息学分析内容参见[高通量测序服务]相关部分。

      2. 基因组学相关分析

      1)序列拼接(基因组的从头组装、基于参考基因组的基因组组装)

      2)DNA序列的两两比对和多序列全局比对(同源性搜索)

      3) EST的基因组定位(基因的可变剪切)

      4)基因功能位点预测(启动子、转录因子结合位点、翻译调控信号等)

      5)基因组重复序列注释(包括SSR, LINE, SINE, DNA Transposon等)

      6)基因预测及结构分析(真核生物和原核生物的编码区预测)

      7)非编码RNA分析(tRNA预测tRNA二级结构预测、miRNA预测、miRNA作用位点预测)

      8)SNP分析(个体基因组中出现的SNP功能注释和疾病相关性预测等)

      9)分子进化相关分析(进化树,分子进化速率KaKs的计算,进化选择分析等)

      10)基因功能注释及分类

      3. 蛋白质组学相关分析

      1)信号肽预测

      2)蛋白质亲/疏水性、等电点分析

      3)蛋白质跨膜蛋白片段预测

      4)蛋白质抗原性分析

      5)蛋白质Pfam结构域分析

      6)蛋白质二级结构预测

      7)蛋白质裂解酶作用位点分析

      4. 基因表达芯片数据分析

      1) 基因芯片表达谱数据预处理

      2) 多个芯片表达数据比较分析(多实验的质量分析和归一化等)

      3) 差异表达基因筛选和统计分析

      4) 差异表达基因聚类分析

      5)差异表达基因功能富集分析(GO分类、KEGG Pathway分析)

      5. 个性化生物信息学分析

      客户提供原始的或含有初步生物信息学分析的高通量测序或各类芯片数据,我们根据客户的具体需求进行个性化分析服务。具体服务内容可包括:

       

      1)根据客户提供的实验设计进行高级生物信息学分析

      2)根据客户需求绘制相关结果图标,并提供中英文图解

      3)协助客户进行学术论文中生物信息学部分相关内容的撰写 

      生物信息学系统构建

      我们将为您提供一站式的生物信息计算系统构建服务(专业的硬件采购+必备实用的软件安装+到位的信息培训),让您在最短的时间内掌握生物信息学的基本技能,提升您科学研究的整体实力。

      生物数据库及软件开发服务

      公司为客户提供如下生物学数据库构建服务:

      1. 基于Java、Web service的生物信息平台开发,如具有特定需求的生物信息数据库和配套服务器系统构建。

      2. 实验室管理信息系统(LIMS)的定制开发。

      服务方式及价格根据所构建的数据库和所开发的软件的具体情况面议。

       

      咨询电话:025-86210556

      生物信息学分析咨询:bioinformatics@decodegenomics.com 


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